对于重症肌无力本身的进一步治疗，除根据原发病的病情选择和调节药物之外，对于并发症也要进行确切的治疗。
重症肌无力病人除常合并胸腺瘤外，还常合并甲状腺功能异常，特别是桥本氏甲状腺炎、甲状腺功能亢进等。另外，全身性红斑狼疮和慢性风湿性关节炎、乙型肝炎，甚至合并特发性血小板减少性紫癜，对于这些合并症要分别地给予相应的处理，但因好些合并症均为自身免疫性疾病，因此，可试用糖皮质激素冲击疗法和血浆置换疗法，均可奏效。对于重症肌无力本身的进一步治疗，特别是长期应用胆碱酯酶抑制剂药物、糖皮质激素治疗而伴有肌萎缩、糖尿病、高血压、白内障、青光眼、胃溃疡、骨质疏松症、颈椎病等并发症者，除根据原发病的病情选择和调节药物之外，对于并发症也要进行确切的治疗。