脑栓塞本身的治疗原则是要改善脑回圈、防止再栓塞、消除脑水肿、保护脑功能。抗凝、溶栓等治疗多仅在发病的早期有作用，因此更强调早期治疗。
大多数病人、病人亲友及部分医务人员在对待该病的治疗中，更多想到或期望的是有更好的药物(实际上目前用于脑栓塞治疗药物的作用是十分有限的)使病人早日康复，而忽视了其他治疗方面，如：病人的饮食，由于相当数量的脑栓塞病人出现生活不能自理，甚至饮食不能(因吞咽困难)，若不给予鼻饲(经鼻插一管到胃，经此管将食物直接注入胃内)，病人的营养、身体内新陈代谢都会很快出现新的问题，如此，即使对脑栓塞本身的治疗用药再好，也难以收到好的治疗效果。 因此，应当把病人的生活护理、饮食、其他合并症的处理摆在首要的位置。 

脑栓塞本身的治疗原则是要改善脑回圈、防止再栓塞、消除脑水肿、保护脑功能。抗凝、溶栓等治疗多仅在发病的早期有作用，因此更强调早期治疗。 

皮下注射低分子肝素(副作用较小)等抗凝剂对早期的脑栓塞具有一定治疗作用，因抗凝剂(尤其是肝素)引起出血的副作用，应用时应排除脑出血，并注意对患者血凝状态进行监测。溶栓类药物(如尿激梅、链激梅等)亦可能仅在早期发挥作用。用血管扩张剂及降血压的药物时，一定注意病人的血压，此类药物所致的血压过低将会导致脑缺血的进一步加重，应十分注意。低分子右旋糖酐可帮助降低血粘度、甘露醇等高渗脱水剂可缓解脑水肿，但应用时要注意病人的心脏功能、肾功能情况，以免顾此失彼。 

对于已明确诊断为风湿性心瓣膜病、人工换瓣术后、冠心病伴心房纤颤、颈动脉等大动脉粥样硬化等疾病者，应选择性给予华法令、阿司匹林、潘生丁、苯磺唑酮、藻酸双酯钠、塞氯匹啶(tickopidine)等药物长期服用可较有效地预防脑栓塞的发生和再发。有条件的心脏瓣膜病患者应尽早合适的心脏手术；初发心房纤颤患者应予及时治疗；外伤骨折病人的搬运转送应符合急救转送要求。 

病情稳定后，在医生的指导下尽早适度进行瘫痪肢体等神经功能缺损的康复锻炼，树立恢复生活自理的信心，配合医疗和康复工作，争取早日恢复，由于神经功能损害后的恢复有其自然规律，肌肉力量、感觉、语言等功能障碍的恢复快慢依脑损害的严重程度不同而异，大多数在病后两周至半年内逐渐恢复，病人、家属必须瞭解这些知识，从而树立起战胜疾病、恢复自我的耐心、信心和毅力。 

社会及家庭给予患者精神及生活的支援，更有利于患者的恢复及生活质量的提高。