常见的病因有：糖原储备和消耗不平衡、糖调节机制不平衡、糖原分解障碍等。
新生儿低血糖症是指凡血糖低于2.2mmol／L( 40mg／dl )的新生儿，不论足月儿或低出生体重儿。其发生率在足月儿中约占0.1％～0.3％，早产儿占43％。常见的病因有：

(一)　糖原储备和消耗不平衡 

早产儿和小于胎龄儿肝糖原储备不足是引起低血糖的主要原因，也与糖原异生功能低下、胰高血糖素反应迟钝有关。新生儿患病时易发生缺氧、酸中毒、低体温和低血压，使儿茶酚胺分泌增加，并出现无氧代谢，加速糖的消耗，使血糖降低。

(二)　糖调节机制不平衡 

维持血糖平衡主要依赖胰岛素促进糖原生成和增糖素促使糖原分解。糖尿病母亲的新生儿胰岛细胞增生，胰岛素分泌过多，常在出生后4～6小时发生低血糖，可持续至生后48小时。

(三)　糖原分解障碍 

糖原累积症和小于胎龄儿可能由于糖原分解减少而发生低血糖。