小儿惊厥容易混淆的疾病有：新生儿惊跳、非惊厥性呼吸暂停及快速眼运动睡眠相等疾病。
决定新生儿尤其是早产儿是否惊厥有时很难。任何奇异的一过性现象或细微的抽动反复性、周期性出现，尤其伴有眼球上翻或活动异常又有惊厥的原因时，应考虑是惊厥发作。惊厥应与下列现象鉴别。

(一)新生儿惊跳

为幅度较大、频率较高、有节奏的肢体抖动或阵挛样动作，将肢体被动屈曲或变换体位可以消除，不伴眼球运动或口颊运动。常见于正常新生儿由睡眠转为清醒时。受到外界刺激时或饥饿时。而惊厥为无节奏抽动，幅度大小不一，不受刺激或屈曲肢体影响，按压抽动的肢体试图制止发作仍感到肌肉收缩，常伴有异常眼、口颊运动。

(二)非惊厥性呼吸暂停

此发作于足月儿为10～15秒／次，早产儿为l0～20秒／次，伴心率减慢40％以上。而惊厥性呼吸暂停发作，足月儿)15秒／次，早产儿)20秒／次，不伴心率改变，但伴有其他部位抽搐及脑电图改变。

(三)快速眼运动睡眠相

有眼部颤动、短暂呼吸暂停、有节奏咀动．面部怪相、微笑、身体扭动等。但清醒后即消失。