本病应与癫痫复杂部分发作相区别，脑电图是主要的鉴别依据。根据临床表现易与夜间的癫痫发作鉴别，在诊断不明确、鉴别困难，需要用多导睡眠描记仪，并加用脑电图电极连续两夜的监测。
夜惊不是癫痫发作，夜惊是睡眠中的异常惊醒，常于人睡后1～2小时发生，系发生在非快速眼动睡眠中的发作性睡觉紊乱。多见于2～5岁儿童，特点是从睡眠中突然坐起、惊叫、两眼直视或紧闭、手足乱动或从床上跳下、表情紧张、呼吸急促、颤抖、意识模糊、打骂父母， 伴有心动过速、出汗、暴怒、瞳孔放大、竖毛等，完全不能安抚，持续数分钟后安静下来继续睡眠，对发作情况能部分回忆，恶梦中发作时患者不能回忆，有些患者清醒后说自己在做恶梦，有一种压迫、闷塞或窒息感等，也可有其他交感神经活动的主观感觉，但大多数对完全清醒前的内容不能回忆，恐怖电影、书籍及过度疲劳、兴奋均可诱发。这种情况多发生于睡眠阶段的深睡3～4期，所以多见于夜间睡眠深睡的前1／3时间。夜惊多为发育过程中的某些因素所致，成年后自行消失。其发生率约占正常儿童的1％-3％。典型的常有夜惊、梦游、遗尿的家族史，也可有梦游伴发，但夜惊的活动范围比梦游要小得多，在发作时夜惊者很少离开房间。青少年或成人的夜惊常伴有精神症状，如焦虑、抑郁、强迫和恐怖，中老年人发生夜惊时则要考虑中枢神经系统病变，如脑瘤或某些大剂量药物(如锂盐)等所致。

本病应与癫痫复杂部分发作相区别，脑电图是主要的鉴别依据。根据临床表现易与夜间的癫痫发作鉴别，在诊断不明确、鉴别困难，需要用多导睡眠描记仪，并加用脑电图电极连续两夜的监测。多导睡眠描记仪可表明夜惊出现在睡眠的Ⅲ期或Ⅳ期，与梦游相似，发作集中在睡眠开始后的几小时内，发作期脑电图记录可见到从慢波睡眠 到低电压，非同步的快波，如仍不能肯定诊断，长程的动态脑电图夜间监测可能是鉴别夜惊和儿童复杂部分发作的重要手段。