青霉素G对和革兰染色阴性厌氧菌有效，每日600万－1000万U，分4次静滴，但脆弱类杆菌多呈耐药。克林霉素对大多数厌氧菌感染均有显著疗效，若与青霉素G联用，对病情较严重的肺厌氧菌感染及脓胸有较好疗效。
青霉素G对和革兰染色阴性厌氧菌有效，每日600万－1000万U，分4次静滴，但脆弱类杆菌多呈耐药。克林霉素对大多数厌氧菌感染均有显著疗效，若与青霉素G联用，对病情较严重的肺厌氧菌感染及脓胸有较好疗效。成人剂量一般为600－900mg，每8小时1次。硝咪唑包类包括甲硝唑（灭滴灵）及替硝唑，临床常用的甲硝唑对多数厌氧菌有效，对脆弱拟杆菌有杀菌作用，厌氧球菌对其亦很敏感，不能对抗需氧菌及兼性厌氧菌，每日剂量400mg，分2次口服，或静脉滴注，5－7天为一疗程。替硝唑对厌氧菌及阴道滴虫具有较强抗菌活性，对脆弱拟杆菌、梭形杆菌及其他拟杆菌的作用较甲硝唑为强，使用于厌氧菌所致各种感染。口服首剂2g，以后每日0.5－1g额，分2次服，静滴每次800mg，每日1次。氟喹诺酮类、氯霉素等有一定疗效。院内感染患者多为混合感染，应与氨基苷类抗生素联用。